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| Art des Jobs | Vollzeit | |
| Eingetragen am | 09.04.2025 | |
| Einsatzort | Braunschweig | |
| Jobbeschreibung | Ihre Aufgaben - Etablierung einer Bioinformatik-Arbeitsgruppe und selbstständige Planung und Durchführung von Forschungsprojekten im Rahmen der Institutsausrichtung; - enge Interaktion mit den Arbeitsgruppen im JKI inkl. Unterstützung bei bioinformatischen Fragestellungen und Datensynthese; - Entwicklung und Anwendung von bioinformatischen Methoden (Genom-, Transkriptom- und Metabolomanalysen) zur Untersuchung und Modellierung von Interaktionen zwischen Kulturpflanzen, deren Mikrobiom und Schaderregern (Viren, Bakterien, Pilze, Nematoden, Nagetiere) sowie zur phylogenetischen bzw. populationsgenetischen Charakterisierung von Schaderregern; - Implementierung und Validierung bioinformatischer Pipelines für die Diagnostik im Nationalen Referenzlabor unter Berücksichtigung des EPPO Standards PM7/151 („Considerations for the use of high throughput sequencing in plant health diagnostics“); - Publikation von Forschungsergebnissen in wissenschaftlichen Fachzeitschriften sowie Präsentation der Forschungs-ergebnisse auf nationalen und internationalen Tagungen und Einwerbung von Drittmitteln. |
| Qualifikationen | Sie haben
- ein abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium der Biologie, Bioinformatik, oder einer vergleichbaren Disziplin mit Promotion; - möglichst Erfahrung mit Mikrobiomen von Kulturpflanzen oder Phytopathologie; - profunde Kenntnisse in Hochdurchsatzsequenzierung von DNA und RNA; - solide Programmierkenntnisse in relevanten Programmiersprachen wie Python, Perl und R, sicherer Umgang mit Linux und möglichst Kenntnisse in Galaxy; - Erfahrungen mit gängigen Sequenzanalyseprogrammen wie Geneious Prime oder CLC Genomic Workbench sowie automatisierten Analysetools wie DADA2, Virtool, PhytoPipe, MiFi o.ä.; - Erfahrungen mit der selbständigen Erstellung bzw. Weiterentwicklung von Analyse-Pipelines für Genomdaten und Datenbankanalysen; - Erfahrungen mit Methoden der multivariaten Statistik (z.B. PCA, CCA, LDA), Versuchsplanung und generalisierten linearen Modellen; möglichst Kenntnisse der Netzwerkanalyse und Modellierung; - nachgewiesene internationale Publikations- und Vortragstätigkeit; - möglichst Erfahrungen im Einwerben von drittmittelbasierten Forschungsprojekten; - gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift; - einen hohen Grad an Selbstständigkeit und Eigeninitiative sowie Flexibilität und Teamfähigkeit. |
| Firma |
Julius Kühn-Institut (JKI) - Bundesforschungsinstitut für Kulturpflanzen 38104 Braunschweig |
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