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wissenschaftliche*r Mitarbeiter*in (w/m/d) im Bereich Bodenmikrobiologie

ID: 271988

Art des Jobs Vollzeit
Eingetragen am 16.09.2024
Einsatzort Braunschweig

Jobbeschreibung Ihre Aufgaben:
- Bodenprobenahmen in Freilanduntersuchungen und deren fachgerechte Lagerungen für anschließende Boden-DNA und RNA Extraktionen
- Aufbau von Bodenmikrokosmen und experimentelle Untersuchungen zur Reaktion des Bodenmikrobioms, insbesondere der Protisten und Bakterien, auf den Eintrag von pathogenen Bakterien
- PCR Amplifikation von taxonomischen und funktionellen mikrobiellen Marker-Genen für die DNA-Sequenzierung und Quantifizierung: Aufarbeitung von Boden-DNA und RNA für Metagenom und Metatranskriptom-Sequenzierungen
- Durchführung von bioinformatischen und statistischen Analysen zur Ermittlung der Assoziation von mikrobiellen Pathogenen mit strukturellen und funktionellen Veränderungen des Bodenmikrobioms
- Präsentation der eigenen Arbeitsergebnisse und des Projekts auf Instituts-internen Seminaren, bei Treffen des Verbundprojekts EcoPath, sowie auf nationalen und internationalen Tagungen
- Erstellung von Berichten und Manuskripten über Forschungsergebnisse zur Publikation in internationalen begutachteten Fachzeitschriften
Qualifikationen Ihr Anforderungsprofil:
- abgeschlossenes Hochschulstudium (Univ.-Diplom, M.Sc.) in den Fachrichtungen Mikrobiologie, Biogeochemie, Geoökologie, Umweltnaturwissenschaften, Bioinformatik oder ähnlicher Fachdisziplinen
- exzellente Kenntnisse der mikrobiellen Ökologie und ein sehr hohes Interesse an Mikrobiom-Forschung und Ökologie
- Kenntnisse in der statistischen Datenanalyse, vorzugsweise mit R
- Kenntnisse der molekularen Ökologie, der Hochdurchsatz-Sequenzierung von DNA und Bioinformatik, einschließlich Erfahrungen mit Kommando-basierten Pipelines (z. B. Qiime 2, Metwrap) und/oder Linux bzw. Python sind wünschenswert
- hohes Organisationstalent, ausgeprägte Teamfähigkeit und sehr gute Kommunikationsfähigkeit
- sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift
- Bereitschaft zu Dienstreisen und Beteiligung an Probenahmen in Deutschland
Firma Johann Heinrich von Thünen-Institut
38116 Braunschweig
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